單細(xì)胞表面蛋白標(biāo)記
Single Cell Surface Protein
在抗體上偶聯(lián)寡核苷酸鏈后和細(xì)胞進(jìn)行孵育，抗體偶聯(lián)的寡核苷酸鏈可和磁珠的寡核苷酸鏈部分互補(bǔ)配對(duì)，將檢測(cè)蛋白轉(zhuǎn)化為檢測(cè)核苷酸，寡核苷酸在擴(kuò)增后被加上對(duì)應(yīng)的細(xì)胞標(biāo)簽序列，起到細(xì)胞標(biāo)記的目的。該方法可同時(shí)檢測(cè)表面蛋白和轉(zhuǎn)錄組，增加細(xì)胞注釋的準(zhǔn)確性，也可用來對(duì)不同樣本進(jìn)行標(biāo)記，降低實(shí)驗(yàn)成本。
技術(shù)原理
（10x Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組為例）
表面蛋白抗體 由靶向特定表面蛋白的抗體和一段標(biāo)識(shí)的Barcode序列兩部分構(gòu)成，將檢測(cè)蛋白轉(zhuǎn)化為檢測(cè)寡核苷酸。
技術(shù)原理 在GEMs構(gòu)建之前，通過孵育使表面蛋白抗體錨定在特定細(xì)胞上，在逆轉(zhuǎn)錄時(shí)，這些抗體聯(lián)接的序列也可以與Beads上的Barcode序列一端互補(bǔ)配對(duì)，由此使標(biāo)記這個(gè)細(xì)胞的Barcode帶上了表面蛋白標(biāo)記。
實(shí)驗(yàn)流程
血液/組織 單細(xì)胞（抗體孵育后） GEMs形成 文庫構(gòu)建 測(cè)序 數(shù)據(jù)處理 數(shù)據(jù)可視化分析
（10x Genomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組為例）
應(yīng)用方向
1. 獲得表面蛋白信息，輔助細(xì)胞定義；
2. 對(duì)關(guān)注細(xì)胞類型進(jìn)行標(biāo)記；
3. 對(duì)樣本進(jìn)行標(biāo)記，降低實(shí)驗(yàn)成本。
