Bulk ATAC測(cè)序
服務(wù)優(yōu)勢(shì)
產(chǎn)品描述
ATAC-Seq技術(shù)的原理是通過(guò)轉(zhuǎn)座酶Tn5容易結(jié)合在開(kāi)放染色質(zhì)的特性,然后對(duì)Tn5酶捕獲到的DNA序列進(jìn)行測(cè)序。DNA轉(zhuǎn)座,是一種把DNA序列從染色體的一個(gè)區(qū)域搬運(yùn)到另外一個(gè)區(qū)域的現(xiàn)象,由DNA轉(zhuǎn)座酶來(lái)實(shí)現(xiàn)。這種轉(zhuǎn)座插入DNA,也是需要插入位點(diǎn)的染色質(zhì)是開(kāi)放的,否則就會(huì)被高級(jí)結(jié)構(gòu)給卡住。
轉(zhuǎn)座酶可以隨機(jī)結(jié)合并切割染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)的DNA,并且可同時(shí)在切割位點(diǎn)插入接頭序列。如下圖,只要將攜帶已知DNA序列標(biāo)簽的轉(zhuǎn)座復(fù)合物(即帶紅色和藍(lán)色序列標(biāo)簽的Tn5轉(zhuǎn)座酶)加入到細(xì)胞核中一起孵育,再利用已知序列標(biāo)簽進(jìn)行PCR擴(kuò)增即可形成文庫(kù),經(jīng)過(guò)測(cè)序就可以獲得染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)的信息。
轉(zhuǎn)座酶可以隨機(jī)結(jié)合并切割染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)的DNA,并且可同時(shí)在切割位點(diǎn)插入接頭序列。如下圖,只要將攜帶已知DNA序列標(biāo)簽的轉(zhuǎn)座復(fù)合物(即帶紅色和藍(lán)色序列標(biāo)簽的Tn5轉(zhuǎn)座酶)加入到細(xì)胞核中一起孵育,再利用已知序列標(biāo)簽進(jìn)行PCR擴(kuò)增即可形成文庫(kù),經(jīng)過(guò)測(cè)序就可以獲得染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)的信息。
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
1、靈敏度高,細(xì)胞起始量低;
2、操作更簡(jiǎn)單,優(yōu)化建庫(kù)、耗時(shí)短;
3、技術(shù)重復(fù)性強(qiáng)、成功率高;
4、檢測(cè)基因組組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子、轉(zhuǎn)錄調(diào)控子結(jié)合位點(diǎn);
5、分析結(jié)果可視化,圖形化的展示peak的富集情況
2、操作更簡(jiǎn)單,優(yōu)化建庫(kù)、耗時(shí)短;
3、技術(shù)重復(fù)性強(qiáng)、成功率高;
4、檢測(cè)基因組組蛋白修飾、轉(zhuǎn)錄因子、轉(zhuǎn)錄調(diào)控子結(jié)合位點(diǎn);
5、分析結(jié)果可視化,圖形化的展示peak的富集情況
實(shí)驗(yàn)流程
數(shù)據(jù)分析
研究方向/思路
送樣要求