封面
DynaSpatial / HD(高分辨率)空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
DynaSpatial / HD Spatial Gene Exprssion
DynaSpatial基于高密度芯片開發(fā)的高分辨率空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序產(chǎn)品,可檢測(cè)組織不同位置細(xì)胞中的基因表達(dá)信息,關(guān)鍵基因檢出性能提升5倍,在癌癥、免疫、神經(jīng)和發(fā)育等領(lǐng)域有著令人期待的應(yīng)用前景。

技術(shù)原理

技術(shù)原理 DynaSpatial一張捕獲芯片對(duì)應(yīng)一個(gè)捕獲區(qū)域,每個(gè)捕獲區(qū)域大小為5×5mm,并密集分布2500個(gè)50μm直徑的捕獲位點(diǎn),相鄰捕獲位點(diǎn)的間距50μm,通過(guò)每個(gè)位點(diǎn)修飾上的barcode序列確定物理坐標(biāo)位置,利用poly (dT)來(lái)捕獲組織切片透化出來(lái)的mRNA,從而進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序和空間基因表達(dá)數(shù)據(jù)生成。
實(shí)驗(yàn)流程

數(shù)據(jù)分析

分析流程


分析結(jié)果展示
                         基礎(chǔ)數(shù)據(jù)質(zhì)控分析                                   細(xì)胞聚類分析                                 細(xì)胞類型注釋

   
                        marker 基因熱圖                                             功能富集分析                                    擬時(shí)分析


產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)產(chǎn)品選擇

高分辨率DynaSpatial HD產(chǎn)品

研究方向

送樣要求
(1)新鮮組織樣本,進(jìn)行OCT冷凍包埋;
(2)包埋組織塊大小為 5*5 mm2, 每個(gè)樣本4個(gè)備份;
(3)切片厚度10μm,組織切片RNA RIN>7.0。