DECODER單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
DECODER單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序
DECODER Well-Paired-Seq
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高通量單細(xì)胞測序平臺(tái)(Well-Paired-Seq)基于雙孔嵌套式芯片,協(xié)同局部準(zhǔn)靜態(tài)流體力學(xué)和尺寸排阻原理,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞和編碼微球高效精準(zhǔn)“配對”,利用準(zhǔn)靜態(tài)流體力學(xué)特性有效清洗背景,具有高效的細(xì)胞捕獲率、細(xì)胞/微球配對效率以及游離RNA去除等優(yōu)勢,實(shí)現(xiàn)高通量細(xì)胞捕獲、高靈敏基因檢出和單細(xì)胞高保真分子解析。
技術(shù)原理
技術(shù)原理 微孔板上3萬或6萬的微孔,利用重力沉降的原理依次加入細(xì)胞和微球,由于微孔和微球數(shù)遠(yuǎn)高于細(xì)胞數(shù),從而微孔板上成千上萬了微孔內(nèi)部存在一個(gè)細(xì)胞和一個(gè)磁珠,后續(xù)用油將微孔封成一個(gè)個(gè)反應(yīng)室,反應(yīng)室內(nèi),細(xì)胞裂解,微珠上存在標(biāo)記細(xì)胞(cell barcode)和RNA分子(UMI)的標(biāo)簽,以及帶有polyT的寡核苷酸鏈,polyT捕獲mRNA的polyA尾巴,后續(xù)基于磁性收集微珠(帶有RNA分子),進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,將細(xì)胞和RNA分析標(biāo)簽加到每一個(gè)RNA分子上,以達(dá)到細(xì)胞標(biāo)簽標(biāo)記細(xì)胞,UMI進(jìn)行RNA定量的目的。
實(shí)驗(yàn)流程
數(shù)據(jù)分析
分析流程
分析結(jié)果展示
DynamicEX質(zhì)控分析 細(xì)胞聚類分析 細(xì)胞類型注釋
marker 基因熱圖 功能富集分析 擬時(shí)分析
研究方向
送樣要求