封面
單細胞表面蛋白標記
Single Cell Surface Protein
在抗體上偶聯(lián)寡核苷酸鏈后和細胞進行孵育,抗體偶聯(lián)的寡核苷酸鏈可和磁珠的寡核苷酸鏈部分互補配對,將檢測蛋白轉化為檢測核苷酸,寡核苷酸在擴增后被加上對應的細胞標簽序列,起到細胞標記的目的。該方法可同時檢測表面蛋白和轉錄組,增加細胞注釋的準確性,也可用來對不同樣本進行標記,降低實驗成本。

技術原理

(10x Genomics單細胞轉錄組為例)

表面蛋白抗體 由靶向特定表面蛋白的抗體和一段標識的Barcode序列兩部分構成,將檢測蛋白轉化為檢測寡核苷酸。
技術原理 在GEMs構建之前,通過孵育使表面蛋白抗體錨定在特定細胞上,在逆轉錄時,這些抗體聯(lián)接的序列也可以與Beads上的Barcode序列一端互補配對,由此使標記這個細胞的Barcode帶上了表面蛋白標記。

實驗流程

     血液/組織   單細胞(抗體孵育后)             GEMs形成             文庫構建                  測序                      數(shù)據(jù)處理               數(shù)據(jù)可視化分析

 (10x Genomics單細胞轉錄組為例)

應用方向

1. 獲得表面蛋白信息,輔助細胞定義;
2. 對關注細胞類型進行標記;
3. 對樣本進行標記,降低實驗成本。

單細胞平臺兼容性