單細胞表面蛋白標記
技術原理
(10x Genomics單細胞轉錄組為例)
表面蛋白抗體 由靶向特定表面蛋白的抗體和一段標識的Barcode序列兩部分構成,將檢測蛋白轉化為檢測寡核苷酸。
技術原理 在GEMs構建之前,通過孵育使表面蛋白抗體錨定在特定細胞上,在逆轉錄時,這些抗體聯(lián)接的序列也可以與Beads上的Barcode序列一端互補配對,由此使標記這個細胞的Barcode帶上了表面蛋白標記。
實驗流程
血液/組織 單細胞(抗體孵育后) GEMs形成 文庫構建 測序 數(shù)據(jù)處理 數(shù)據(jù)可視化分析
(10x Genomics單細胞轉錄組為例)
應用方向
1. 獲得表面蛋白信息,輔助細胞定義;
2. 對關注細胞類型進行標記;
3. 對樣本進行標記,降低實驗成本。