宏基因組測序
產(chǎn)品簡介
宏基因組學(Metagenomics)研究通過全基因組鳥槍法(Whole Genome Shotgun,WGS)測序策略,將提取獲得的微生物組總DNA隨機打斷為短片段,并構建合適長度的插入片段文庫,對這些文庫進行雙端(Paired-end,PE)高通量測序,從而能精細地展示整個菌群的功能代謝譜和物種精細組成譜,進而在組成和功能水平分別挖掘關鍵生物標記物,從原理上闡明微生物群落在生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮作用的根本機制。
產(chǎn)品特點
1.可以直接獲得微生物功能基因的相對豐度
2.基于已知物種,鑒定分辨率可達物種、甚至菌株水平
3.不需要微生物群落相關的先驗知識(如捕獲噬菌體、病毒、質(zhì)粒以及微小真核生物等)
4.基本不會產(chǎn)生PCR偏好性
5.可以估算有參考基因組微生物的原位生長速率
6.可組裝獲得群體平均基因組(甚至可以獲得其中一些微生物較完整的基因組)
7.可以挖掘新的基因家族。
2.基于已知物種,鑒定分辨率可達物種、甚至菌株水平
3.不需要微生物群落相關的先驗知識(如捕獲噬菌體、病毒、質(zhì)粒以及微小真核生物等)
4.基本不會產(chǎn)生PCR偏好性
5.可以估算有參考基因組微生物的原位生長速率
6.可組裝獲得群體平均基因組(甚至可以獲得其中一些微生物較完整的基因組)
7.可以挖掘新的基因家族。
數(shù)據(jù)分析
分析內(nèi)容
部分分析結(jié)果展示
應用場景
送樣要求