DynaSpatial / HD(高分辨率)空間轉(zhuǎn)錄組
技術(shù)原理
技術(shù)原理 DynaSpatial一張捕獲芯片對應(yīng)一個捕獲區(qū)域,每個捕獲區(qū)域大小為5×5mm,并密集分布2500個50μm直徑的捕獲位點,相鄰捕獲位點的間距50μm,通過每個位點修飾上的barcode序列確定物理坐標(biāo)位置,利用poly (dT)來捕獲組織切片透化出來的mRNA,從而進(jìn)行建庫測序和空間基因表達(dá)數(shù)據(jù)生成。
實驗流程
數(shù)據(jù)分析
分析流程
分析結(jié)果展示
基礎(chǔ)數(shù)據(jù)質(zhì)控分析 細(xì)胞聚類分析 細(xì)胞類型注釋
marker 基因熱圖 功能富集分析 擬時分析
產(chǎn)品優(yōu)勢產(chǎn)品選擇
高分辨率DynaSpatial HD產(chǎn)品
研究方向
送樣要求
(1)新鮮組織樣本,進(jìn)行OCT冷凍包埋;
(2)包埋組織塊大小為 5*5 mm2, 每個樣本4個備份;
(3)切片厚度10μm,組織切片RNA RIN>7.0。