1710390389139
RNA原位測序技術服務(ISS)|
In Situ Sequencing,ISS
新型RNA原位測序作為空間組學技術之一,在完整組織切片上以亞細胞分辨率定量單細胞內(nèi)的高度多重RNA表達水平,具有亞細胞空間分辨率、基因檢出靈敏度高和組織全景覆蓋等優(yōu)點,是一種完美結合組織、細胞和分子不同層面信息的前沿技術,在器官發(fā)育、神經(jīng)科學、腫瘤免疫等研究領域有廣闊的應用前景。

技術原理


技術原理 原位測序技術 (In Situ Sequencing,ISS) 依賴于雙連接和滾環(huán)擴增技術,它是以缺口靶向(Gap-targeted Sequencing) 或條形碼靶向 (Barcode-targeted Sequencing) 為測序策略,同時引入邊連接邊測序的化學原理(Sequencing-by-ligation Chemistry),以滾環(huán)擴增產(chǎn)物為測序媒介進而在組織或細胞原位對RNA實現(xiàn)短片段測序的技術。

技術流程

(1)定制探針:針對用戶提供的基因的非保守區(qū)設計探針并合成

(2)樣本前處理:將冰凍切片退凍、固定、脫水和透化,以便探針和反應所需的酶等成分進入組織細胞內(nèi)部

(3)探針雜交與滾環(huán)擴增:探針與RNA雜交,之后連接成環(huán);通過滾環(huán)擴增反應放大編碼信號

(4)原位成像:利用邊合成邊測序的化學原理,通過采集熒光信號得到對應位置的編碼堿基;經(jīng)過序列解碼,可識別出該位置靶向結合的基因

(5)圖像分析:獲得每個靶基因在組織中的空間表達位置,用不同符號(或顏色)標記在同一張組織圖像中;通過細胞邊界識別等方法得到單細胞水平的基因表達定量數(shù)據(jù),可進行高級分析

產(chǎn)品優(yōu)勢

(1)高效、特異、高敏

(2)高信噪比

(3)可實現(xiàn)256種靶標分子檢測

(4)亞細胞分辨率


技術優(yōu)勢

數(shù)據(jù)分析


應用思路

應用場景

檢測結果展示
人胰腺樣本50基因原位測序結果
樣本類型
  1. 冷凍組織OCT包埋樣本或者切片
  2. 石蠟包埋組織樣本或者切片(FFPE樣本) 
  3. 細胞爬片樣本等