RNA原位測序技術服務(ISS)
技術原理
技術原理 原位測序技術 (In Situ Sequencing,ISS) 依賴于雙連接和滾環(huán)擴增技術,它是以缺口靶向(Gap-targeted Sequencing) 或條形碼靶向 (Barcode-targeted Sequencing) 為測序策略,同時引入邊連接邊測序的化學原理(Sequencing-by-ligation Chemistry),以滾環(huán)擴增產(chǎn)物為測序媒介進而在組織或細胞原位對RNA實現(xiàn)短片段測序的技術。
技術流程
(1)定制探針:針對用戶提供的基因的非保守區(qū)設計探針并合成
(2)樣本前處理:將冰凍切片退凍、固定、脫水和透化,以便探針和反應所需的酶等成分進入組織細胞內(nèi)部
(3)探針雜交與滾環(huán)擴增:探針與RNA雜交,之后連接成環(huán);通過滾環(huán)擴增反應放大編碼信號
(4)原位成像:利用邊合成邊測序的化學原理,通過采集熒光信號得到對應位置的編碼堿基;經(jīng)過序列解碼,可識別出該位置靶向結合的基因
(5)圖像分析:獲得每個靶基因在組織中的空間表達位置,用不同符號(或顏色)標記在同一張組織圖像中;通過細胞邊界識別等方法得到單細胞水平的基因表達定量數(shù)據(jù),可進行高級分析
產(chǎn)品優(yōu)勢
(1)高效、特異、高敏
(2)高信噪比
(3)可實現(xiàn)256種靶標分子檢測
(4)亞細胞分辨率
技術優(yōu)勢
數(shù)據(jù)分析
應用思路
應用場景
檢測結果展示
人胰腺樣本50基因原位測序結果
樣本類型
- 冷凍組織OCT包埋樣本或者切片
- 石蠟包埋組織樣本或者切片(FFPE樣本)
- 細胞爬片樣本等