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單細胞免疫組庫
Single Cell Immune Profiling
單細胞免疫分析解決方案可以在單細胞水平獲得全長、配對的 V(D)J 序列，獲得樣本的免疫組庫，以便發(fā)現(xiàn)和疾病相關的抗體類型。
技術原理

（10x Genomics單細胞轉錄組為例）


1. 形成GEMs 基于微流控芯片形成油包水（GEMs），每個油包水內(nèi)含有一個細胞、一個gel bead以及逆轉錄需要的引物試劑和酶等，單個GEM內(nèi)可進行獨立逆轉錄反應互不干擾。 

2. 標記細胞和RNA分子 Gel bead上帶有標簽，GEMs進行逆轉錄，可將10x barcode（10x BC，用來標記細胞)、UMI（標記本底RNA進行定量）加在每個mRNA分子上。

3. 巢式PCR富集全長V(D)J序列 基于T細胞和B細胞VDJ序列設計巢式PCR引物，富集全長V(D)J序列

實驗流程

     血液/組織   單細胞/核懸液                          GEMs形成             文庫構建                  測序                      數(shù)據(jù)處理               數(shù)據(jù)可視化分析

 

（10x Genomics單細胞轉錄組為例）

技術優(yōu)勢

1）可實現(xiàn)成對的重鏈和輕鏈（B細胞）或α和β鏈（T細胞）的全長測序；
2）精細到單細胞水平，能獲得大量單細胞的免疫組庫數(shù)據(jù)；
3）同批樣本可同時獲得mRNA表達譜數(shù)據(jù)和免疫組庫數(shù)據(jù)；

單細胞平臺兼容性


數(shù)據(jù)分析

分析流程



分析結果展示
                       單細胞質(zhì)控                                       克隆型分析                                        轉錄組和TCR/BCR聯(lián)合分析


研究方向

1）抗體的鑒定和新抗體的發(fā)現(xiàn)
2）揭示Ig 庫的發(fā)展，繪制全局Ig 庫
3）研究傳染性疾病，如感染發(fā)展中的抗體進化譜系等
4）研究免疫失調(diào)疾病的V(D)J 重組傾向性，尋找免疫失調(diào)疾病的標記物
5）癌癥早期檢測、癌癥進程和復發(fā)診斷的標記物以及腫瘤免疫機制的研究

文獻案例

送樣要求